Μέσα από τις οικονομικές καταστάσεις τής ΝΕΛ για το 2013 που δόθηκαν στη δημοσιότητα αργά το βράδυ της Δευτέρας, έγινε γνωστό τι προβλέπει η συμφωνία εξυγίανσης της ΝΕΛ.

Ειδικότερα προβλέπει πώς οι εργαζόμενοι θα λάβουν το σύνολο των δεδουλευμένων τους. Το Δημόσιο, τα Ν.Π.Δ.Δ. και οι ασφαλιστικοί οργανισμοί θα λάβουν το σύνολο των κατά κεφάλαιο απαιτήσεών τους με μεσοπρόθεσμη αποπληρωμή, δηλαδή σε βάθος πενταετίας. Οι Millennium Bank και FBB θα λάβουν περίπου το 20% των απαιτήσεών τους με μακροχρόνια αποπληρωμή. Οι πιστωτές αυτοί έχουν το δικαίωμα, αντί της οφειλής όπως αυτή περιορίζεται με τη συμφωνία εξυγίανσης, να ζητήσουν να τους μεταβιβαστούν πλοία της εταιρείας επί των οποίων ήδη έχουν προτιμώμενες ναυτικές υποθήκες. Σήμερα η Τράπεζα Millennium έχει απορροφηθεί πλήρως από τον Τράπεζα Πειραιώς και η FBB, από την Εθνική Τράπεζα, κατά συνέπεια όσα δικαιώματα και υποχρεώσεις απορρέουν από τη συμφωνία, έχουν μεταβιβαστεί σε αυτές.
Οι υπόλοιποι πιστωτές και προμηθευτές τής ΝΕΛ θα λάβουν το 20% των απαιτήσεών τους σε 48 μηνιαίες δόσεις.

Οι τράπεζες και οι λοιποί πιστωτές μπορούν, αντί της μείωσης και της ρύθμισης των απαιτήσεών τους, να ζητήσουν την κεφαλαιοποίηση των συνολικών απαιτήσεών τους με την έκδοση νέων μετοχών και με τιμή διαθέσεως ίση με την ονομαστική αξία της μετοχής (0,30 ευρώ). Αν ενεργοποιηθεί αυτή η πρόβλεψη, σημαίνει πως ο Όμιλος της ΝΕΛ θα περάσει στον πλήρη έλεγχο της Τράπεζας Πειραιώς.
Οι απαιτήσεις των μετόχων της εταιρείας διαγράφονται οριστικά.

Οι επίδικες απαιτήσεις θα ικανοποιηθούν σε ποσοστό 20% και σε 36 μηνιαίες δόσεις από τη λήξη της επιδικίας.
Παράλληλα, στη συμφωνία προβλέπεται και η πιθανότητα συμμετοχής τής ήδη μετόχου Altana Navigation Ltd σε αύξηση του μετοχικού κεφαλαίου μέχρι το ποσό του ενός εκατομμυρίου ευρώ. Επίσης προβλέπεται η μεταβίβαση προς την Altana Navigation Ltd, των μετοχών των εταιρειών Antelope Shipping Inc, Ercolana Holdings Ltd και ISFI- Square Fund.

Επιπρόσθετα, με το από 13 Σεπτεμβρίου 2012 ιδιωτικό συμφωνητικό μεταξύ της Millennium Bank και των εταιρειών του Ομίλου τής ΝΕΛ, περιορίστηκαν ή ρυθμίσθηκαν και οι όφειλες των λοιπών εταιρειών. Συγκεκριμένα οι υποχρεώσεις C-Link ρυθμίζονται με μακροχρόνια καταβολή, οι υποχρεώσεις τής Silver Fin Ltd περιορίζονται κατά 72% και το υπόλοιπο επίσης θα καταβληθεί μακροχρόνια, ενώ αντιστοίχως περιορίζεται και η υποθήκη επί του πλοίου της εταιρείας.